Protein–RNA interactions for Protein: P0C7L0

Wipf3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wipf3P0C7L0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wipf3P0C7L0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wipf3P0C7L0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wipf3P0C7L0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wipf3P0C7L0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wipf3P0C7L0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wipf3P0C7L0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Wipf3P0C7L0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wipf3P0C7L0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wipf3P0C7L0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wipf3P0C7L0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wipf3P0C7L0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wipf3P0C7L0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wipf3P0C7L0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Wipf3P0C7L0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Wipf3P0C7L0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wipf3P0C7L0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wipf3P0C7L0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wipf3P0C7L0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Wipf3P0C7L0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wipf3P0C7L0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wipf3P0C7L0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Wipf3P0C7L0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wipf3P0C7L0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms