Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NefmP08553 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NefmP08553 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NefmP08553 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NefmP08553 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NefmP08553 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NefmP08553 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NefmP08553 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NefmP08553 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NefmP08553 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NefmP08553 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NefmP08553 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NefmP08553 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NefmP08553 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NefmP08553 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NefmP08553 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NefmP08553 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NefmP08553 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NefmP08553 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NefmP08553 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NefmP08553 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NefmP08553 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NefmP08553 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NefmP08553 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NefmP08553 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NefmP08553 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NefmP08553 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NefmP08553 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NefmP08553 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NefmP08553 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NefmP08553 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NefmP08553 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NefmP08553 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NefmP08553 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NefmP08553 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NefmP08553 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NefmP08553 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NefmP08553 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NefmP08553 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NefmP08553 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NefmP08553 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NefmP08553 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NefmP08553 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NefmP08553 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NefmP08553 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NefmP08553 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NefmP08553 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NefmP08553 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NefmP08553 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefmP08553 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefmP08553 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefmP08553 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefmP08553 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefmP08553 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefmP08553 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefmP08553 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefmP08553 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefmP08553 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefmP08553 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefmP08553 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefmP08553 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NefmP08553 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefmP08553 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefmP08553 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefmP08553 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NefmP08553 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NefmP08553 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NefmP08553 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NefmP08553 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NefmP08553 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NefmP08553 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NefmP08553 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NefmP08553 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NefmP08553 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NefmP08553 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NefmP08553 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NefmP08553 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NefmP08553 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NefmP08553 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NefmP08553 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NefmP08553 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NefmP08553 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NefmP08553 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NefmP08553 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NefmP08553 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NefmP08553 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NefmP08553 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NefmP08553 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NefmP08553 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NefmP08553 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NefmP08553 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NefmP08553 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NefmP08553 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NefmP08553 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NefmP08553 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NefmP08553 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NefmP08553 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NefmP08553 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NefmP08553 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NefmP08553 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms