Protein–RNA interactions for Protein: P06797

Ctsl, Cathepsin L1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtslP06797 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtslP06797 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtslP06797 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtslP06797 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtslP06797 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtslP06797 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtslP06797 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CtslP06797 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtslP06797 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtslP06797 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtslP06797 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtslP06797 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtslP06797 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtslP06797 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtslP06797 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtslP06797 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtslP06797 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtslP06797 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtslP06797 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtslP06797 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtslP06797 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtslP06797 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtslP06797 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtslP06797 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtslP06797 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtslP06797 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtslP06797 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtslP06797 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtslP06797 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtslP06797 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtslP06797 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtslP06797 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtslP06797 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtslP06797 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtslP06797 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtslP06797 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtslP06797 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtslP06797 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtslP06797 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtslP06797 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CtslP06797 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtslP06797 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtslP06797 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtslP06797 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtslP06797 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtslP06797 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtslP06797 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtslP06797 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtslP06797 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtslP06797 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtslP06797 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtslP06797 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtslP06797 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtslP06797 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CtslP06797 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtslP06797 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CtslP06797 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CtslP06797 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtslP06797 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtslP06797 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtslP06797 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtslP06797 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CtslP06797 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtslP06797 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtslP06797 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtslP06797 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtslP06797 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtslP06797 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtslP06797 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtslP06797 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtslP06797 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtslP06797 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CtslP06797 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtslP06797 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtslP06797 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtslP06797 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtslP06797 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtslP06797 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtslP06797 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtslP06797 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtslP06797 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtslP06797 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtslP06797 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtslP06797 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CtslP06797 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CtslP06797 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CtslP06797 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtslP06797 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtslP06797 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtslP06797 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtslP06797 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtslP06797 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtslP06797 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtslP06797 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtslP06797 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtslP06797 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtslP06797 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtslP06797 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtslP06797 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtslP06797 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms