Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01822 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01822 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01822 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01822 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01822 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01822 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01822 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01822 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01822 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01822 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01822 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01822 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01822 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01822 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01822 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01822 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01822 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01822 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01822 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01822 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01822 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01822 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms