Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01679 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01679 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01679 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01679 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01679 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01679 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01679 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01679 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01679 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01679 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01679 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01679 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01679 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01679 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01679 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01679 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01679 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01679 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01679 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01679 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01679 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01679 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01679 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01679 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01679 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01679 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01679 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01679 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01679 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01679 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01679 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01679 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01679 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01679 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01679 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01679 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01679 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01679 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01679 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01679 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01679 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01679 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01679 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01679 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01679 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01679 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01679 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01679 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01679 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01679 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01679 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01679 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01679 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01679 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01679 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01679 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01679 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01679 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01679 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01679 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01679 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01679 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01679 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01679 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01679 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01679 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01679 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01679 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01679 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01679 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01679 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01679 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01679 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01679 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01679 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01679 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01679 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01679 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01679 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01679 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01679 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01679 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01679 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01679 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01679 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01679 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01679 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01679 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01679 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01679 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01679 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01679 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01679 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01679 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01679 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01679 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01679 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01679 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01679 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms