Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lancl1O89112 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lancl1O89112 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lancl1O89112 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms