Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms