Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms