Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnnt1O88346 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt1O88346 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms