Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid1O70583 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mid1O70583 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mid1O70583 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mid1O70583 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mid1O70583 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mid1O70583 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mid1O70583 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mid1O70583 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mid1O70583 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mid1O70583 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms