Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb5O70309 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itgb5O70309 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms