Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd70O55237 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd70O55237 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd70O55237 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd70O55237 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd70O55237 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd70O55237 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd70O55237 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd70O55237 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms