Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtogO55225 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtogO55225 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtogO55225 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
OtogO55225 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtogO55225 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtogO55225 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtogO55225 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtogO55225 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtogO55225 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtogO55225 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtogO55225 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtogO55225 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtogO55225 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtogO55225 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtogO55225 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtogO55225 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtogO55225 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtogO55225 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtogO55225 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
OtogO55225 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtogO55225 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtogO55225 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtogO55225 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtogO55225 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtogO55225 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OtogO55225 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtogO55225 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtogO55225 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtogO55225 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OtogO55225 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtogO55225 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtogO55225 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtogO55225 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtogO55225 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OtogO55225 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtogO55225 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtogO55225 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OtogO55225 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtogO55225 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtogO55225 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OtogO55225 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
OtogO55225 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
OtogO55225 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
OtogO55225 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
OtogO55225 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtogO55225 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtogO55225 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtogO55225 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtogO55225 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtogO55225 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtogO55225 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
OtogO55225 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtogO55225 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtogO55225 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
OtogO55225 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
OtogO55225 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtogO55225 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtogO55225 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtogO55225 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
OtogO55225 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtogO55225 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtogO55225 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtogO55225 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtogO55225 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtogO55225 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtogO55225 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtogO55225 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
OtogO55225 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtogO55225 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
OtogO55225 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtogO55225 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
OtogO55225 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtogO55225 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
OtogO55225 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtogO55225 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtogO55225 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtogO55225 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtogO55225 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtogO55225 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtogO55225 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtogO55225 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtogO55225 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtogO55225 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtogO55225 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtogO55225 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtogO55225 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms