Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Tlx3O55144 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tlx3O55144 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tlx3O55144 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tlx3O55144 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tlx3O55144 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tlx3O55144 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tlx3O55144 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms