Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdkO55028 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdkO55028 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdkO55028 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdkO55028 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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BckdkO55028 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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BckdkO55028 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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BckdkO55028 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdkO55028 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdkO55028 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BckdkO55028 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdkO55028 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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