Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc3O55013 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms