Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LatO54957 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LatO54957 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LatO54957 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LatO54957 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LatO54957 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LatO54957 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LatO54957 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LatO54957 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LatO54957 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LatO54957 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LatO54957 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LatO54957 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LatO54957 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LatO54957 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LatO54957 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LatO54957 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LatO54957 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LatO54957 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LatO54957 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LatO54957 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LatO54957 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LatO54957 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LatO54957 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LatO54957 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LatO54957 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LatO54957 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LatO54957 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LatO54957 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LatO54957 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LatO54957 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LatO54957 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LatO54957 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LatO54957 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LatO54957 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LatO54957 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LatO54957 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LatO54957 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LatO54957 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LatO54957 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LatO54957 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LatO54957 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LatO54957 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LatO54957 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LatO54957 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LatO54957 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LatO54957 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LatO54957 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LatO54957 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LatO54957 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LatO54957 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LatO54957 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LatO54957 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LatO54957 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LatO54957 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LatO54957 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LatO54957 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LatO54957 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LatO54957 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LatO54957 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LatO54957 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LatO54957 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LatO54957 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LatO54957 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LatO54957 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LatO54957 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LatO54957 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LatO54957 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LatO54957 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LatO54957 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LatO54957 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms