Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole2O54956 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pole2O54956 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole2O54956 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole2O54956 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole2O54956 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pole2O54956 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms