Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f6O54917 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f6O54917 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f6O54917 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f6O54917 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f6O54917 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms