Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DffaO54786 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DffaO54786 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DffaO54786 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DffaO54786 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DffaO54786 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DffaO54786 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DffaO54786 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DffaO54786 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DffaO54786 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DffaO54786 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DffaO54786 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DffaO54786 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DffaO54786 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DffaO54786 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DffaO54786 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DffaO54786 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DffaO54786 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DffaO54786 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DffaO54786 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DffaO54786 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DffaO54786 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DffaO54786 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DffaO54786 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DffaO54786 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DffaO54786 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DffaO54786 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DffaO54786 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DffaO54786 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DffaO54786 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DffaO54786 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DffaO54786 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DffaO54786 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DffaO54786 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DffaO54786 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DffaO54786 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DffaO54786 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DffaO54786 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DffaO54786 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DffaO54786 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DffaO54786 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DffaO54786 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DffaO54786 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DffaO54786 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DffaO54786 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DffaO54786 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DffaO54786 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DffaO54786 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DffaO54786 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DffaO54786 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DffaO54786 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DffaO54786 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DffaO54786 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DffaO54786 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DffaO54786 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DffaO54786 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DffaO54786 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DffaO54786 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DffaO54786 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DffaO54786 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DffaO54786 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DffaO54786 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DffaO54786 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DffaO54786 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DffaO54786 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DffaO54786 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DffaO54786 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DffaO54786 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DffaO54786 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DffaO54786 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DffaO54786 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DffaO54786 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DffaO54786 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DffaO54786 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DffaO54786 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DffaO54786 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DffaO54786 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DffaO54786 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DffaO54786 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DffaO54786 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DffaO54786 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DffaO54786 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DffaO54786 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DffaO54786 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DffaO54786 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DffaO54786 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DffaO54786 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DffaO54786 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DffaO54786 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DffaO54786 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DffaO54786 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DffaO54786 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DffaO54786 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DffaO54786 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DffaO54786 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DffaO54786 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DffaO54786 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DffaO54786 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DffaO54786 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DffaO54786 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms