Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Clk3O35492 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk3O35492 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk3O35492 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk3O35492 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk3O35492 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk3O35492 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk3O35492 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk3O35492 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk3O35492 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk3O35492 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk3O35492 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk3O35492 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk3O35492 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk3O35492 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk3O35492 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk3O35492 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk3O35492 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk3O35492 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk3O35492 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk3O35492 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk3O35492 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Clk3O35492 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Clk3O35492 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk3O35492 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk3O35492 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk3O35492 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk3O35492 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk3O35492 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk3O35492 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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