Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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TnxbO35452 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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TnxbO35452 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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TnxbO35452 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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TnxbO35452 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TnxbO35452 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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TnxbO35452 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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TnxbO35452 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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TnxbO35452 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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TnxbO35452 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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TnxbO35452 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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TnxbO35452 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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TnxbO35452 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TnxbO35452 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TnxbO35452 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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TnxbO35452 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms