Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna3O35344 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna3O35344 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms