Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkd2O35245 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms