Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Lrrc23O35125 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc23O35125 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms