Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sypl1O09117 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms