Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MttpO08601 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MttpO08601 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MttpO08601 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MttpO08601 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MttpO08601 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MttpO08601 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MttpO08601 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MttpO08601 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MttpO08601 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MttpO08601 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MttpO08601 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MttpO08601 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MttpO08601 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MttpO08601 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MttpO08601 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MttpO08601 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MttpO08601 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MttpO08601 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MttpO08601 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MttpO08601 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MttpO08601 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MttpO08601 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MttpO08601 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MttpO08601 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MttpO08601 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MttpO08601 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MttpO08601 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MttpO08601 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MttpO08601 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MttpO08601 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MttpO08601 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MttpO08601 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MttpO08601 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MttpO08601 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MttpO08601 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MttpO08601 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MttpO08601 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MttpO08601 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MttpO08601 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MttpO08601 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MttpO08601 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MttpO08601 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MttpO08601 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MttpO08601 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MttpO08601 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MttpO08601 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MttpO08601 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MttpO08601 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MttpO08601 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MttpO08601 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MttpO08601 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MttpO08601 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MttpO08601 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MttpO08601 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MttpO08601 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MttpO08601 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MttpO08601 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MttpO08601 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MttpO08601 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MttpO08601 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MttpO08601 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MttpO08601 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MttpO08601 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MttpO08601 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MttpO08601 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MttpO08601 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MttpO08601 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MttpO08601 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MttpO08601 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MttpO08601 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MttpO08601 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MttpO08601 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MttpO08601 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MttpO08601 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MttpO08601 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MttpO08601 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MttpO08601 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MttpO08601 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MttpO08601 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MttpO08601 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MttpO08601 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MttpO08601 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MttpO08601 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MttpO08601 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MttpO08601 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MttpO08601 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MttpO08601 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MttpO08601 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MttpO08601 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MttpO08601 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MttpO08601 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MttpO08601 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MttpO08601 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MttpO08601 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MttpO08601 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MttpO08601 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MttpO08601 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MttpO08601 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MttpO08601 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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