Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efna4O08542 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efna4O08542 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efna4O08542 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna4O08542 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna4O08542 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna4O08542 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna4O08542 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna4O08542 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Efna4O08542 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Efna4O08542 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Efna4O08542 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna4O08542 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Efna4O08542 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Efna4O08542 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Efna4O08542 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Efna4O08542 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna4O08542 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna4O08542 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna4O08542 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna4O08542 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Efna4O08542 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna4O08542 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna4O08542 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna4O08542 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna4O08542 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna4O08542 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Efna4O08542 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna4O08542 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna4O08542 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Efna4O08542 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna4O08542 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Efna4O08542 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Efna4O08542 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna4O08542 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna4O08542 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Efna4O08542 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Efna4O08542 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna4O08542 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Efna4O08542 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna4O08542 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Efna4O08542 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Efna4O08542 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Efna4O08542 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Efna4O08542 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Efna4O08542 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Efna4O08542 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Efna4O08542 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efna4O08542 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efna4O08542 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Efna4O08542 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efna4O08542 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Efna4O08542 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Efna4O08542 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efna4O08542 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efna4O08542 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Efna4O08542 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efna4O08542 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Efna4O08542 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efna4O08542 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efna4O08542 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efna4O08542 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efna4O08542 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna4O08542 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna4O08542 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna4O08542 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna4O08542 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Efna4O08542 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna4O08542 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna4O08542 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna4O08542 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna4O08542 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna4O08542 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna4O08542 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Efna4O08542 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms