Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa8J3QNX5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms