Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20918J3QN17 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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