Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf4bG5E8Z2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms