Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrna9G3X8Z7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrna9G3X8Z7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms