Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd5G3UW60 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms