Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20517G3UVU6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms