Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Gm28038F7BCN9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Gm28038F7BCN9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Gm28038F7BCN9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Gm28038F7BCN9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28038F7BCN9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
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