Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8444F6XS56 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms