Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Raph1F2Z3U3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Raph1F2Z3U3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms