Protein–RNA interactions for Protein: E9QAE1

Nckap5, NCK-associated protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5E9QAE1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nckap5E9QAE1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nckap5E9QAE1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nckap5E9QAE1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nckap5E9QAE1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nckap5E9QAE1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nckap5E9QAE1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nckap5E9QAE1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nckap5E9QAE1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nckap5E9QAE1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nckap5E9QAE1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nckap5E9QAE1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nckap5E9QAE1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nckap5E9QAE1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nckap5E9QAE1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nckap5E9QAE1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nckap5E9QAE1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nckap5E9QAE1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nckap5E9QAE1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nckap5E9QAE1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nckap5E9QAE1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms