Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
6030445D17RikE9Q8F9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms