Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U8

Vmn2r35, Vomeronasal 2, receptor 35, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r35E9Q7U8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r35E9Q7U8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r35E9Q7U8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r35E9Q7U8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r35E9Q7U8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r35E9Q7U8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r35E9Q7U8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms