Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col22a1E9Q7P1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col22a1E9Q7P1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms