Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp31E9Q6Y8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms