Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Simc1E9Q6E9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Simc1E9Q6E9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms