Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms