Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nolc1E9Q5C9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms