Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tarbp1E9Q368 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tarbp1E9Q368 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tarbp1E9Q368 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms