Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3095E9Q058 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms