Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gcom1E9PZ54 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms