Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Brd1E9PZ26 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms