Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Parp4E9PYK3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms